峰静香和佐也香母女拜托毛利小五郎保护家中的宝刀，原因是怪盗基德发出预告，将要盗取宝刀据为己有。听到谈话的少年侦探团自然不会错过这个大好机会，他们跟随小五郎和小兰来到峰家。在这里，他们遇见了蛮横的老婆婆、天真的剑客铁刃以及自信满满的风雷藏，当然还有峰家的奇怪宠物们。小五郎听信了雷藏的话，放心大胆地和剑十郎开怀畅饮起来。 到了指定时间，基德潜入峰家，不过他这一次的行动可不轻松。先是遭到宠物秃鹫的撞击，...

某天，柯南因感冒在家休息，期间接到了灰原哀的电话。原来灰原做出了APTX-4869的最新解药，虽然只是试制品，但一心恢复工藤新一身份的柯南仍然迫不及待赶往阿笠博士的实验室。服药后，新一终于回到原有状态，不过周遭的一切却似乎有所改变：博士院子里的树长高了，出现许多新的建筑物，体育老师变得苍老，班里的同学全是陌生面孔，甚至元太、光彦和步美也都变成高中生的模样。 他找到同样变成高中生的灰原，得知自己在过...

某天早晨，柯南（高山南 配音）被阿笠博士（绪方贤 壹配音）叫到了棒球场。此时厂商正在进行一场小学生之间的棒球赛，分属GUTS和TRYS两队的青梅竹马美苗（野中蓝 配音）和阿明（宫田幸季 配音）相互对抗。柔弱的美苗被阿明轻松击败，落寞的美苗不慎被什么东西绊倒，原来是一根半没于地下的球棒。阿笠博士说这是名将松井秀喜的球棒，传说能拔起它的将获得极高的棒球天赋。赛程过半，美苗的球队落后，她将责任都归到自己...

大雨滂沱之日，两个奇怪的不速之客造访天道道场，他们一个是体形庞大的熊猫，一个是娇小可爱的少女。正当天道一家疑惑不解之时，经热水泡过的熊猫和少女竟然变成了中年大叔和英俊少年。原来，大叔是天道道场馆主天道早云的朋友，名叫早乙女玄马，是一个迷恋修行的武痴。十几年来他带着儿子乱马走遍全国各地，更远赴中国修行，然而在青海咒泉乡修炼时父子俩不慎落入熊猫泉和少女泉中，从此他们遇到冷水就会变身，与热水就会回复正常...

近未来，为了治疗现代人类越来越多、越来越严重的精神疾病，位于东京的精神医疗综合研究所开发出一种可以反映他人梦境的机器。通过微型DC的帮助，梦境在显示器上呈现出来，更方便找到一个人焦虑的症结。某日，三台微型DC失窃，与之相关的研究人员的梦境接连被人侵入，随后受到严重伤害。美女医疗师千叶敦子另一个身份是梦境侦探“红辣椒”，她能够与患者同步体验梦境。为避免盗贼利用微型DC进一步作恶，她不得不潜入受害者的...

这日柯南、小兰一行人来到米花市市政大厅，一场有关最新游戏“茧”的发布会正在这里召开。由于迥异于以往任何一款游戏的“茧”可能一举改变全球游戏业界的价值观，发布会吸引了代表日本上流社会的政治、财经、演艺界人士，50名游戏体验者也多是他们的后代，新一的父亲、推理小说大师工藤优作由于参与故事编写，也来到现场。这边热热闹闹，游戏的研发者兼负责人坚村却被杀于地下室。坚村死前留在键盘J、T、R上的血迹令柯南想到...

“听说相爱的两个人如果能一起进东京大学（简称东大），他们就能获得[幸福]哦！所以，在我们两个长大以後，就两个一起进东大去读书吧！”景太郎就是因为小时与一个连姓名也不记得的女孩的约定誓要考进东大。15年後，景太郎并没有因为失败过2次而放弃，下定决心考进东大！在父母极力反对的情况下，景太郎为了约定以及解决住宿的问题，只好来到他奶奶经营的雏田庄借宿。但在一个偶然的机遇下（他奶奶去寻找新的旅程去了）景太郎...

“通灵王大赛”每500年举行一次，胜出者可得到代表一切的伟大精神（精灵王），而主角麻仓叶虽然没有意愿参加，但基于他是麻仓家子孙而去参赛，以阻止其双胞胎兄长，同时亦是他祖先麻仓叶王得到伟大精神G.S（精灵王），原因是麻仓叶王要创造一个只有通灵者的世界。当中麻仓叶认识了来自中国的通灵人道莲、来自北海道的轰隆轰隆、英国的瑞瑟格、美国的巧克力爱情等，共同向通灵王的目标进发。动画中期之后进行与漫画不同。...

公元2052年。世界迎来了前所未有的和平时代，脑神经学博士斯金纳开发的镇痛剂“哈普那”做出了巨大贡献。哈普那作为没有副作用的“奇迹之药”，在全世界广泛传播，将人类从痛苦中解放出来。但是，它的开发者斯金纳突然消失了，谁也不知道他的去向。3年后，他以引导世界走向毁灭的恶魔身份再次出现。“哈普那”是使服用者在3年后发病并致死的药物，是设下的陷阱。“还有30天。如果在那之前找到我所在的地方，人类就能生存下...

位于北海道函馆的斧江财阀的收藏库收到了来自怪盗基德的预告函。据说这次基德盯上的是幕末的新选组副长土方岁三的日本刀。追寻大宝石的基德，为什么要以刀为目标呢……另一边，西部名侦探服部平次和柯南他们，也为了在函馆举办的剑道大会到访了当地，犯罪预告当天，平次彻底识破了基德的乔装将其逼至绝境，但……与此同时，在函馆仓库街发现了胸部被切出十字形伤痕的遗体。侦查线索上浮现的是被称为“死亡商人”的、在亚洲一带作为...